最早的药酒名称见于先秦两汉时期，如《内经》年的“鸡牙庙”和《金匮要略》年的“洪兰花酒”等。且多以一方中的单味药或主药名称作为药酒名称。这种方法成为后来药酒命名的重要方法。
最古老的药酒方子，和其他中药方子一样，没有名字。在马王堆出土的帛书中，并没有记载药酒药方的具体名称。这种情况在唐代的许多方剂中仍然存在，如《干金要方脾脏下》“治疗腹泻、绞痛、肠滑不可缺少的方剂。”《外台秘要》第15卷《风痹、瘾疹治方》等。
最早的药酒名称见于先秦两汉时期，如《内经》年的“鸡牙庙”和《金匮要略》年的“洪兰花酒”等。且多以一方中的单味药或主药名称作为药酒名称。这种方法成为后来药酒命名的重要方法。汉代以后，药酒的命名方法逐渐增多，传统的命名方法可以概括为：单味药制成的药酒，如羌活酒，以药名为酒名。由两种药物配制的药酒，多以两种药物合称，如五倍子明矾酒。多药配制的药酒，以一两种主药命名，如羌独活酒，或以一种容易记忆的方法命名，如乌蛇酒、乌荆酒、五指酒、二藤酒。以人名为药酒名，如臧宫酒、石锅贡酒、北地太守酒等。以示纪念。为了区分，有时人们的名字与药物名称或功效共同命名，如崔氏黄酒、周公百年老酒等。以功能主治命名，如退热当归酒、御风酒、红岩酒、腰痛酒等。这种命名方式，在传统的命名方式中，也占了相当大的比重。以中药的方剂和名称作为药酒的名称，如八珍酒、十全大补酒等。
此外，还有一些从其他角度命名的药酒，如白药酒、玉液酒、紫液酒、吴须酒、神仙酒、清囊酒等。数量不多，不一一列举。
由于命名方法多以主药或功效为依据，且历代有药酒的专著均已失传，有些专著没有分类，多数药酒方药与其他方药穿插使用，因此在命名和分类上存在一些问题。据本书原集记载，以虎骨酒命名的方剂有33个，其中单味方剂8个，复方方剂25个。复方中药有40多味，最少也只有两味。它们的成分差别很大，效果也明显不同。但都是用同一个名字，虎骨酒，不好区分，给应用和分类带来困难。因此，我们对药酒的命名进行了必要的修改。变化的原理如下。
(1)为了尽可能保持原貌，一些名称不太确切或非常相似的药酒，尤其是古方，只要不重复其他药酒的名称，就不会更改。如虎骨酒、虎骨酒、虎骨酒、虎骨酒，都是复方药酒。它们的名称与虎骨酒不同，药物成分和名称也略有不同，就不改了。当然，现在老虎已经成为珍稀保护动物，不能再当药酒了。
(2)根据药酒功能主治的特点进行变化。
(3)根据菜谱特点总结命名。即在主药之外，选择另一种药来搭配和命名。匹配方法：如果只有两种药，匹配另一种药的名称。
(4)部分药酒处方中加“复方”字样，以示区别。
(5)现代编纂中反复命名的复方药酒，编号为
此外，相同名称、含量相同或相近的药酒应合并。因为后世医书很多内容都是前人编集的，比如明代的《普济方》，宋代的很多药酒方子都是由《圣济总录》和《太平圣惠方》编集的，成分完全相同，所以我们把它们合并了。对于少数处方，其制备方法、服用方法、功能主治基本相同，或者只有处方中几十种药物中的少数几种无明显疗效。这可能是古人抄写校勘的遗漏和推导。我们将删除药味短的方剂，避免内容繁杂重复，将内容相同的单味药酒进行合并，使《中国药酒大全》的内容尽可能“丰富实用”。
中国药酒经历了几千年的发展，主要作用有：既包括中国古代两千年前的一些疾病名称和症状，也包括现代医学中的一些疾病名称和症状。这属于两个理论体系，目前还很难统一。中药药酒是中药的一部分，我们首先要保持它的传统，但也不能忽视它的发展。为此，我们采用目前两种理论体系都接受的大家族分类，包括保健、内外医学、妇女、儿童、骨伤、皮肤、五官、口腔牙病等。
一些目前没有定论的疾病古名、症状、功用等被大量列举，而适应症不明确的药酒也不勉强归类合并到“其他”中，有待今后进一步研究和探讨。
